Как отмечается в Письме Минфина РФ от 01.09.2016 № 03-07-11/51102, осуществляемые федеральным государственным учреждением УИС операции по внутрисистемной реализации товаров, в том числе произведенных с привлечением другого федерального государственного учреждения УИМ, освобождаются от обложения НДС.